DNA 분석 및 특성 분석

EBPI 애널리틱스는 산업 파트너를 통해 미생물 군집 특성 분석을 제공하는 것을 자랑스럽게 생각합니다. CENSUS(qPCR), Quantarray, Next Generation Sequencing(NGS) 분석 모두 개별 미생물 종을 식별하는 데 사용되는 미생물 군집 프로필을 제공합니다. 이 기술들은 현장 관리자와 엔지니어가 부식 과정을 손상시키는 원인 미생물, 생물 복원에 중요한 미생물 커뮤니티의 표적 구성원, 원치 않는 박테리아 오염원을 추적하는 데 비용 효율적으로 매우 유용합니다.

• 환경 오염에 대한 자연 감쇠 조치의 실현 가능성을 평가합니다
• 향상된 생물복원의 효능을 분석하고 생물증강이 필요한지 판단합니다
• 특정 오염물질 분해에 책임이 있는 생물(염소화 유기물, BTEX, PAHs)의 높은 농도를 확인하여 민감한 유출 지점을 식별하고 생물 복원을 모니터링합니다
• 자연 자원 인프라에서 부식을 일으키는 생물의 높은 수치를 찾아보고, 조기 구조적 파손을 예측하며, 선제적인 교체 전략을 촉진하세요

CENSUS (qPCR)

CENSUS는 정량적 중합효소 연쇄반응(qPCR)이라는 혁신적인 분자생물학 도구(MBT)를 기반으로 하며, 특정 유전자의 여러 복제본을 생성합니다. 각 유전자 복제본이 만들어질 때마다 형광 마커가 방출되고 측정되어 샘플 내 표적 유전자의 수를 정량화하는 데 사용됩니다. 이 과정에서 복제되는 유전자(표적)는 반응 혼합물에 첨가되는 짧은 DNA 구간인 '프라이머'에 의해 결정됩니다. 본질적으로 qPCR은 카운터가 있는 복사기와 같습니다. "프라이머"는 책의 어떤 페이지(대상)를 복사할지 결정하고, 카운터는 복사된 페이지 수(샘플 내 목표 유전자 수)를 기록합니다.

CENSUS 장점

• 정확 — DNA는 샘플에서 직접 추출되어 박테리아를 배양할 필요가 없어, 플레이트 카운트 같은 전통적인 기반 접근법에서 발생하는 편향을 우회합니다.
• 특이적 — 특정 박테리아군(예: 데할로코코이데스) 또는 원하는 기능을 암호화하는 특정 유전자(예: 환원 탈염소)를 표적으로 삼습니다.
• 신속 — 결과는 며칠 이내(표준 TAT 기준 7–10) 내에 제공되며, 긴급 서비스도 제공됩니다.
• 감도 — 샘플당 100개의 세포까지 낮은 실용 검출한계(PDL)로, 동적 범위는 7자릿수 이상입니다.
• 유연성 — 분석은 물, 토양, 퇴적물, 바이오 트랩® 등 다양한 샘플 유형에 대해 수행할 수 있습니다.
• 광범위한 적용 가능성 — 다양한 생물과 미생물 기능을 대상으로 한 CENSUS 검사.

QUANTARRAY

퀀트어레이는 DNA 마이크로어레이의 고도로 병렬 검출과 qPCR의 정확하고 정밀한 정량화를 단일 플랫폼으로 결합한 하이브리드 기술입니다. 이 접근법의 핵심은 저부피 용액상 qPCR을 위한 나노리터 유체 분석으로, 다양한 유전자 표적을 동시에 정량하여 보다 포괄적인 부위 평가를 가능하게 합니다. 다른 여러 면에서 QuantArray는 프로브를 사용하는 기존 qPCR과 동일하므로 동일한 정확도와 정밀도를 기대할 수 있습니다. qPCR은 특정 유전자의 여러 복제본을 생성하는 과정입니다. 이 과정에서 복제되는 유전자(표적 유전자)는 '프라이머'라고 불리는 짧은 DNA 구간과 '프로브'로 결정됩니다. 각 유전자 복제본이 만들어질 때마다 형광 마커가 프로브에서 방출되어 측정되어 샘플 내 표적 유전자 수를 정량화합니다. 다중화 qPCR과 같은 다른 방법들은 어느 정도 병렬 정량을 달성하는 방법들이 기술되어 있습니다. 하지만 QuantArray와 다중화 qPCR 사이에는 근본적인 차이가 있습니다. 다중화 qPCR의 경우, 여러 개의 프라이머 세트를 반응 혼합물에 추가하여 여러 유전자 표적을 정량합니다. 다중화 qPCR과 달리, QuantArray는 개별 qPCR 반응을 위한 이산적인 관통구멍을 사용하여 반응 동역학이 손상되지 않도록 보장합니다.